小豆基因组测序鉴定完成:与菜豆是近亲
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小豆作为古老栽培作物起源于中国,在全世界30多个国家和地区种植,被广泛用于食品及保健品中。日前,由北京农学院万平教授与中国科学院遗传与发育生物学研究所凌宏清和田志喜研究员领衔的研究团队与深圳华大基因研究院合作,完成了小豆全基因组测序。 该团队利用第二代测序技术对小豆全基因组进行鸟枪法测序,获得了90.88 Gb有效序列。通过这些测序结果,并与已知豆科植物的基因组比较及共线性分析,证实小豆与菜豆亲缘关系最近。另外还解析了小豆和大豆籽粒中淀粉和脂肪积累差异,不是由淀粉和油脂合成相关基因数目变化引起,而是由这些基因的转录表达量所导致。 小豆基因组测序的完成,将促进小豆重要农艺性状基因的鉴定与克隆和分子育种,提升中国小豆的研究水平。获得的基因组信息为比较基因组学研究提供丰富的数据资源,也有助于豆科物种进化和驯化关系研究,解析豆类植物在长期进化过程中代谢差异形成的分子机制。 该研究成果于2015年10月12号在美国科学院院报PNAS杂志在线发表。北京农学院的杨凯教授、中国科学院遗传与发育生物学研究所的田志喜研究员、华大基因研究院的陈春海和罗龙海为共同第一作者,北京农学院的万平教授、中国科学院遗传与发育生物学研究所的凌宏清研究员、华大基因研究院的王俊研究员以及国际半干旱作物研究所的Rajeev K. Varshney博士为共同通讯作者。该项目受到北京市教委基础研究与技术创新项目和国家自然科学基金委项目的支持。